中共潮州港经济开发区工作委员会为市委的派出机构，潮州港经济开发区管理委员会为市人民政府的派出机构（正处级），在市委、市政府授权范围内依法对潮州港经济开发区实行统一领导、统一管理。其主要职责是：

　　（一）贯彻执行党的方针政策和国家有关法律法规，以及省、市有关政策和工作部署，对开发区的重大问题进行研究，拟订有关规范性文件并组织实施。

　　（二）负责编制开发区经济发展、基础设施建设中长期规划及年度计划，配合饶平县编制区域内的相关规划，并组织实施。

　　（三）负责开发区土地管理与开发，市政基础设施和公共设施的建设、管理及维护等工作。协助饶平县做好开发区自然资源管理工作。

　　（四）负责开发区招商合作、产业布局和相关企业项目管理服务等工作。

　　（五）负责开发区的财政预算内外资金收支管理和投融资管理工作。

　　（六）负责开发区生态环境、应急管理的日常巡查监督，协助饶平县做好开发区生态环境、应急管理的执法检查工作。

　　（七）承担闽粤经济合作区（潮州）的相关工作。

　　（八）负责机关党群工作。

　　（九）完成市委、市政府交办的其他事项。

　　（十）职能转变。开发区聚焦主责主业，集中精力抓经济发展，重点做好园区环境提升、招商引资、项目建设和企业服务等工作。开发区内涉及的行政审批、经济管理事项，按照“属地原则”全部由饶平县相关行政管理部门依法依规按照县一级权限办理。